اخوان که دلیل برگزاری اولین جلسه‌اش با خبرنگاران را در ساختمان یکی از شبکه‌های زیرمجموعه صدا و سیما اهمیت مسائل برون‌مرزی در فضای مجازی می‌داند، به صورت ضمنی در پاسخ به این سوال که آیا صحت دارد که شما محل کار سابق خود را که در زیرمجموعه وزارت ارتباطات واقع است به مدیر جدید نداده‌‌اید، می‌گوید:«موضوع ساختمان مرکز ملی فضای مجازی یک موضوع حاشیه‌ای و جنبی است، حتما این موضوع با نظر رئیس‌جمهور برطرف می‌شود.»
شورای عالی فضای مجازی 10 اسفندماه با حکم مقام معظم رهبری موجودیت می‌یابد. اولین جلسه آن با حضور 13 عضو حقوقی و 7 عضو حقیقی در آخرین روزهای سال 90 به ریاست محمود احمدی‌نژاد تشکیل می‌شود و دبیر و رئیس مرکز ملی فضای مجازی پس از یک دوره تقریبا سه‌ماهه در تاریخ شش خردادماه از سوی رئیس‌جمهور انتخاب می‌شود.
اخوان به عنوان رئیس مرکز ملی فضای مجازی هنوز دو روزی از دریافت حکمش از رئیس‌جمهور نگذشته بود که 8 خردادماه به رغم تایید و تاکید محمود احمدی‌نژاد که خطاب به او نوشته بود:«امیدوارم با استفاده از توان (...) موسسه تحقیقات ارتباطات و فناوری اطلاعات و با ایجاد مرکز فضای مجازی نسبت به انجام ماموریت‌های محوله اقدام کنید.» با حکم دیگری از سوی رضا تقی‌پور وزیر ارتباطات و فناوری اطلاعات مواجه شد که به صورت ضمنی عملا ناقض تاکیدهای رئیس‌جمهور تلقی شد. تقی‌پور فردی دیگر را به جای اخوان روانه مرکز تحقیقات مخابرات می‌کند: دکتر مرتضی براری. اگر مهدی اخوان بهابادی در پاسخ به خبرگزاری مدافع رضا تقی‌پور با احتیاط جواب داد که موضوع ساختمان مرکز یک موضوع حاشیه‌ای است اما در جای دیگر تاکید کرد:«از وزیر ارتباطات و فناوری اطلاعات خواستیم که طرح ایجاد شبکه ملی اطلاعات را به شورای عالی فضای مجازی ارسال کند.»
مهدی اخوان بهابادی به عنوان معاون وزیر ارتباطات به وزارتخانه می‌آید، سرپرست مرکز تحقیقات می‌شود و به قائم‌مقامی وزیر می‌رسد اما در نهایت امروز به دبیری و ریاست مرکزی می‌رسد که نه‌تنها بر فراز وزارت ارتباطات و فناوری اطلاعات قرار دارد بلکه در پاسخ به سوال دیگر در خصوص شوراهای عالی مرتبط می‌گوید:«شوراهای فعال در ذیل وزارتخانه‌ها و کارگروه‌ها و کمیته‌های حوزه فضای مجازی از این پس با هماهنگی مرکز ملی فضای مجازی فعالیت خود را ادامه خواهند داد که این به معنای انحلال این تشکل‌ها نخواهد بود، بلکه طبق نقشه‌ای که در مرکز ملی فضای مجازی در حال تدوین است شاید بخشی از وظایف مرکز را به همین شوراها و کارگروه‌ها بدهیم و حدود مسوولیت‌هایشان را مشخص می‌کنیم.»
نام اخوان پس از ورود به وزارت ارتباطات با طرح ایده رساندن فیبر به منازل یا همان اپراتور چهارم و افزایش پهنای باند تا 20 مگابیت برای همگان آشنا شد. او اگرچه به عنوان رئیس مرکزی ملی فضای مجازی خود تاکید می‌کند به دلیل جایگاهش تمایلی ندارد در مورد فعالیت‌های گذشته‌اش در وزارت ارتباطات سخنی بگوید اما تاکید می‌کند:«هم‌اکنون برای شبکه ملی اطلاعات طرح‌های مشابه در کشور مانند آی‌پی تیوی و آی‌پی مدیا داریم که توسط صدا و سیما در حال پیگیری است و از آنجا که زمینه‌های اشتراکی در این طرح‌ها وجود دارد و باید روی مراکز داده داخلی شکل گیرند، می‌بایست بررسی دقیقی با جزییات صورت گیرد تا چنانچه ممکن است در قالب طرح مشترک یا جداگانه با توجه به تصمیم‌گیری‌های مراجع این طرح‌ها راه‌اندازی شود اما در نهایت امید می‌رود که ارائه خدمات چندرسانه‌ای امسال برای مردم ممکن شود.»
طبق گفته اخوان شورای عالی فضای مجازی به ریاست محمود احمدی‌نژاد از 10 اسفندماه سال 90 تاکنون 10 جلسه با حضور اعضای دیگر تشکیل داده است، این در حالی است که پیش از برگزاری اولین جلسه خبری اخوان به عنوان رئیس مرکز و دبیر شورا، هیچ خبر رسمی‌ای از این شورا منتشر نشده بود جز اخبار برگزاری جلسات این شورا که توسط شبکه تلویزیونی برون‌مرزی پرس تیوی منتشر شده بود.
اعلام آمادگی شورای عالی اطلاع‌رسانی با شورای عالی فضای مجازی
شورای عالی اطلاع‌رسانی به عنوان اولین شورا آمادگی خود را برای هماهنگی کامل با شورای عالی فضای مجازی اعلام کرد.
به گزارش روابط عمومی دبیرخانه شورای عالی اطلاع‌رسانی دبیرخانه شورای عالی اطلاع‌رسانی از بین متولیان امر فناوری اطلاعات در کشور، اولین نهادی است که قائل به ایجاد این نهاد فراسازمانی و فراقوه‌ای بوده است.
قائم‌مقام دبیر شورای عالی اطلاع‌رسانی اعلام کرد:«پیشنهاد اولیه برای شکل‌گیری چنین مرجعی از ناحیه این دبیرخانه مطرح شده و پس از تعیین دبیر آن که رئیس مرکز فضای مجازی کشور نیز محسوب می‌شود، طی جلساتی حضوری، خواستار هماهنگی عملکرد با این شورا شده‌ایم.»
